Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA04

Tmem89, Transmembrane protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem89Q9DA04 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmem89Q9DA04 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms