Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D9S1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D9S1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms