Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms