Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms