Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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