Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SlirpQ9D8T7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SlirpQ9D8T7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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