Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl4Q9D8E6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl4Q9D8E6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms