Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fip1l1Q9D824 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fip1l1Q9D824 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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