Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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