Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capns2Q9D7J7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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