Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tube1Q9D6T1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms