Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms