Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a3Q9D554 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms