Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Erich6bQ9D4S6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Erich6bQ9D4S6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms