Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms