Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snapc3Q9D2C9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snapc3Q9D2C9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms