Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bcas2Q9D287 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Bcas2Q9D287 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Bcas2Q9D287 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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