Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Spns3Q9D232 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms