Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nde1Q9CZA6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nde1Q9CZA6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nde1Q9CZA6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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