Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ChtopQ9CY57 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms