Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms