Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx47Q9CWX9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms