Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot11Q9CWN7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms