Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pfdn1Q9CWM4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pfdn1Q9CWM4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pfdn1Q9CWM4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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