Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psma8Q9CWH6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma8Q9CWH6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms