Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rprd1bQ9CSU0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rprd1bQ9CSU0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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