Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms