Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TpbpbQ9CQC0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms