Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkp2Q9CQ73 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkp2Q9CQ73 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms