Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rwdd4Q9CPR1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms