Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim3Q99PE5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim3Q99PE5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim3Q99PE5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim3Q99PE5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim3Q99PE5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim3Q99PE5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim3Q99PE5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim3Q99PE5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim3Q99PE5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim3Q99PE5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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