Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

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Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp26Q99MX1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp26Q99MX1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp26Q99MX1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp26Q99MX1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp26Q99MX1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Usp26Q99MX1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Usp26Q99MX1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp26Q99MX1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp26Q99MX1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp26Q99MX1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms