Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpgs1Q99MS8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms