Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp1b4Q99ME6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp1b4Q99ME6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms