Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nus1Q99LJ8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nus1Q99LJ8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nus1Q99LJ8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nus1Q99LJ8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nus1Q99LJ8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nus1Q99LJ8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nus1Q99LJ8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms