Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lysmd3Q99LE3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lysmd3Q99LE3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms