Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pagr1aQ99L02 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pagr1aQ99L02 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms