Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep3Q99KK1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep3Q99KK1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms