Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CsprsQ99388 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms