Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim59Q922Y2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms