Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prpf3Q922U1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms