Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Afg3l1Q920A7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Afg3l1Q920A7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Afg3l1Q920A7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Afg3l1Q920A7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg3l1Q920A7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms