Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atl3Q91YH5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atl3Q91YH5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms