Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx15Q91WE1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx15Q91WE1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms