Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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