Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms