Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vps4aQ8VEJ9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms