Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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