Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc12Q8R344 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms