Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sf3b4Q8QZY9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sf3b4Q8QZY9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms